Καλημέρα,
Υποθέτω ότι στον development server δουλεύει σωστά.
Θα πρότεινα να ελέγξεις σε ποια κωδικοσελίδα είναι αποθηκευμένα τα αρχεία του code behind. Υποψιάζομαι ότι είναι αποθηκευμένα σαν ANSI.
Για να το ελέγξεις, άνοιξε ένα αρχείο με το κλασικό notepad και πάτα File->Save As και έλεγξε στην επιλογή Encoding. Αν είναι ANSI θα πρέπει να τα μετατρέψεις σε utf8.
Αν πρόκειται για πολλά αρχεία, καλό είναι να βρεις ένα μετατροπέα. Στο SourceForge υπάρχει ο cp-converter. Δεν είναι τίποτα εκπληκτικό, αλλά θα κάνεις την δουλειά σου.