Ωραία, τώρα το είδα... (Sorry, εγώ δοκίμαζα άλλο πράγμα)
Ναι, και αυτό είναι απόρροια του νέου τρόπου που δουλέυει ο designer ως προς το visual inheritance.
Λοιπόν, κοίτα τι γίνεται, έχεις δύο λύσεις:
1) Θα πρέπει να φτιάξεις αντίστοιχα properties στο UserControl που θα κάνουν propagate τα properties προς τα intrinsic controls. Δηλαδή στον κώδικα του UserControl να προσθέσεις
Public Property Button1Text() As String
Get
Return Me.Button1.Text
End Get
Set(ByVal value As String)
Me.Button1.Text = value
End Set
End Property
2) Να βάλεις τον κώδικα που θές να εκτελείται πχ UserControl1.Button1.Text = "Test" στον constructor της φόρμας
Αν βάλεις να φαίνονται τα κρυφά αρχεία, θα δεις ότι οι αλλαγές που κάνεις στο user control δεν περνάνε στο InitializeComponent sub ως κώδικας παρά μόνο αν είναι properties του UserControl
Vir prudens non contra ventum mingit