Το θεωρητικό trend πάντως είναι να κοπούν τελείως αυτά τα πράγματα με το σκεπτικό ότι δεν πρέπει η scripting γλώσσα να μπορεί να επηρεάζει την εφαρμογή η οποία την καλεί.
Θα μπορούσες ενδεχομένως να ανοίξεις ένα νέο παράθυρο όπως το θέλεις, και μέσα από εκεί να κλείσεις ο παλιό, αν και θα βγάλει ο IE προειδοποίηση στον χρήστη ότι το script προσπαθεί να του κλείσει το παράθυρο (όπως και πρέπει να κάνει). Αν είσαι σε intranet περιβάλλον, ίσως μπορέσεις να ρυθμίσεις τους IE να μην βγάζουν αυτή την προειδοποίηση.
Χρήστος Γεωργακόπουλος