Καλημέρα.,
εξαρτάται πώς θέλεις να λειτουργεί. Αν εννοείς ότι θέλεις να αλλάξεις τον τρόπο που εμφανίζεται στους browsers των mobile συσκευών τότε ο όρος που πρέπει να αναζητήσεις είναι τα media queries. Αυτό πρακτικά σημαίνει ότι βάζεις καινούριους CSS κανόνες οι οποίοι θα ενεργοποιούνται σε οθόνες μικρότερων διαστάσεων (Responsive site). Από εκεί και πέρα μπορείς να προχωρήσεις περισσότερο τσεκάροντας τον User Agent του request όπου αναφέρεται (τις περισσότερες φορές) η συσκέυή και να σερβίρεις κατά περίπτωση τελείως άλλη HTML αν και αυτό έχει περισσότερη δουλειά.
Τέλος αν θέλεις να το κάνεις το site - mobile application τότε πρέπει να μετατρέψεις όλες τις μεταφορές δεδομένων σε AJAX Requests και να χρησιμοποιήσεις κάποιο πακέτο όπως το Phonegap.