Το πρόβλημά σου φαίνεται να τείνει να είναι σε ποια βάση συνδέεται κάθε εφαρμογή. Πιθανώς αν έχουν την ίδια γραμμογράφηση και τα ίδια δεδομένα, θα μπορούσες να θέσεις και στα δύο web applications να έχουν το ίδιο connection string και να χρησιμοποιούν την ίδια βάση...
George J.