Ευχαριστώ για την απάντηση. Τελικά τζάμπα ασχολήθηκα με τα τα localization resources.

Είναι εμπορικό site, άρα το ranking στο google είναι πιο σημαντικό. Αλλαξα τη δομή του site και χρησιμοποίησα υποφακέλους με το γνωστό παραδοσιακό τρόπο.
Το να βάλω qureystrings, νομίζω, πάλι δε θα έλυνε το πρόβλημα αφού το google μπορεί να πήγαινε στο link την αλλαγή γλώσσας αλλά θα έβλεπε πάλι την ίδια page πχ Home.aspx, άρα για ποιο λόγο να την ξανασκανάρει?? Ισως καποιος SEO να μπορει να μας διαφωτίσει!